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多组学关联分析鉴定耐多药结核病血清标志

2019-9-10 11:04| 发布者: admin| 查看: 108| 评论: 0
摘要: 肺结核(TB)的流行,特别是耐多药结核病(MDR-TB),已成为今天结核病治疗的一个重大挑战。浙江大学细胞生物学研究所李继承教授领衔的课题组采用iTRAQ标记结合2D LC-MS/MS,以及Solexa测序对MDR-TB患者,药物敏感结 ...
多组学关联分析鉴定耐多药结核病血清标志

肺结核(TB)的流行,特别是耐多药结核病(MDR-TB),已成为今天结核病治疗的一个重大挑战。浙江大学细胞生物学研究所李继承教授领衔的课题组采用iTRAQ标记结合2D LC-MS/MS,以及Solexa测序对MDR-TB患者,药物敏感结核病(DS-TB)患者,和健康对照组血清中的蛋白质组和miRNA组进行了比较分析,鉴定出MDR-TB诊断的潜在生物标志物。相关研究工作发表在1月刊的International Journal of Biological Sciences。生物通 www.ebiotrade.com

相比于DS-TB患者和健康对照组,课题组在MDR-TB患者血清中共鉴定出50个差异表达蛋白质和43个差异表达miRNAs(差异倍数>1.50或<0.60,P值<0.05)。研究人员发现22%的差异表达蛋白质和32.56%差异表达miRNAs是相关的,可以构建一个主要为补体系统的网络。在MDR-TB患者,DS-TB患者,和健康对照组中,CD44抗原(CD44),凝血因子XI(F11),激肽原1(KNG1),miR-4433b-5p,miR-424-5p,和miR-199b-5p存在显著差异表达。这个结果已被ELISA和SYBR Green qRT-PCR所验证。与靶基因预测一致,miR-199b-5p与KNG1存在显著负相关(r=-0.232,P=0.017)。此外,研究人员还建立了基于5个标志物(CD44,KNG1,miR-4433b-5p,miR-424-5p,和miR-199b-5p)的MDR-TB诊断模型。在本项目中,联川生物协助课题组完成了血清miRNA测序分析,miRNA测序数据和蛋白质组定量数据关联分析的工作。生物通 www.ebiotrade.com

本研究提出了MDR-TB诊断的潜在生物标志物,并提供了一个新的理解MDR-TB发病机制的实验基础。

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